Розвиток та облаштування пункту пропуску «Ужгород», з огляду на його значимість, було включено до інвестиційного проекту Програми прикордонного співробітництва ТАСIS, оскільки ефективне функціонування транзитної системи залежить від розвинутої транспортної структури міжнародного значення, облаштування на високому рівні пунктів пропуску через кордон.
Після закінчення першого етапу реконструкції МАПП «Ужгород» почнеться другий, що передбачає оновлення та осучаснення об’єктів митної інфраструктури з пропуску пасажирського автотранспорту. Значення цій роботі додає наближення Євро-2012, адже через перехід «Ужгород» уболівальники з сусідніх країн їхатимуть на футбольні матчі, що відбуватимуться в Україні.
Після завершення обох етапів реконструкції добова пропускна спроможність МАПП «Ужгород» становитиме: легкових автомобілів – 5000 одиниць /нині -1400/, вантажівок – 500 /180/, автобусів – 80/29/, громадян – 10 тисяч осіб /5 тисяч/.